Le Prytanée Militaire de Kati est un établissement militaire. Il a pour mission de forger des futurs cadres militaires et civils nationaux et internationaux des deux sexes, à travers un enseignement fondamental, secondaire (général et technique), une instruction militaire, une formation physique et morale. Cependant, pour atteindre ses objectifs, l'école emploie des personnels militaires nationaux en internationaux et du personnel civil compétent..

Le Prytanée Militaire de Kati est commandé par un Officier Supérieur des Forces Armées nommé par décret du Président de la République sur proposi- tion du Ministre chargé des Forces Armées. Il est responsable de l'ensemble du fonctionnement administratif, pédagogique, du respect de la discipline dans tous les domaines et à tous les niveaux.Il est placé sous l'autorité du Directeur des Écoles Militaires et porte le titre de Commandant de l'école.